根據微生物生長所需碳源的不同，反硝化細菌可以分為自養反硝化細菌和異養反硝化細菌，其中大部分 反硝化細菌為異養反硝化細菌，它們需要利用有機碳源進行反硝化.。在反硝化過程中有機碳源主要用于 異化硝酸鹽還原、同化合成細胞、脫氮或轉化成細胞貯藏碳源，同時異養反硝化細菌生長過程中也需要 大量的有機碳源為其提供能量和營養物質.在生物反硝化過程中，碳源對反硝化過程中的脫氮能力與效率 起著決定性作用。

其中，反硝化菌在缺氧的條件下以碳源為電子供體，硝態氮為電子受體，將亞硝酸氮和硝酸氮還原成氮 氣，從而達到去除氮污染物.當反硝化過程中碳源供應不足時，會使反硝化速度降低，這是因為當有機碳 供應不足時反硝化細菌會利用自身的原生質進行內源反硝化，最終減少細菌的細胞質。

此外，在污水中常常伴有磷，磷的生物去除是通過聚磷菌完成的，聚磷菌會與反硝化菌爭奪碳源，由此加劇原水碳源不足的矛盾，因此，投加外碳源是保證反硝化細菌正常生命活動，促進污水氮磷去除效果 的有效手段。

外加碳源種類及其影響

因不同碳源分子結構各不相同，其作為外加碳源去除污水中氮磷的效果也有一定差異. 但在反硝化過程 中，能夠快速被生物降解、不會產生二次污染的碳源是反硝化過程中電子供體的最佳選擇.目前主要研究 的外加碳源有: 傳統外加碳源( 甲醇、乙醇，乙酸鈉，葡萄糖) 、廢棄物作為外加碳源、污泥作為外加 碳源等。